猪链球菌2型新基因岛SSGI4的发现
祝令伟;蔡雪辉;刘军;齐翀;孙洋;田园;纪雪;李鹏;冯书章;
军事医学科学院军事兽医研究所;哈尔滨兽医研究所;
A novel genomic island SSGI4 in Streptococcus suis serotype 2
摘要 目的通过比较猪链球菌2型强毒株与弱毒株和无毒株的基因组差异,发现新的基因岛,探讨猪链球菌的基因群水平转移及其与致病性之间的关系。方法在已知猪链球菌2型强毒株全基因组序列和对可能基因岛的分析基础上,通过DNA测序和生物信息学分析,对基因岛的结构进行分析鉴定,并预测其功能。结果发现了一个只存在于猪链球菌2型中国强毒株,而在弱毒株和无毒株中整体缺失的新基因岛,命名为SSGI4。基因岛全长11 269bp,G+C含量(36.8%)明显低于基因组总G+C含量(41.1%),基因岛两端均有10bp的正向重复序列,并且末端携带有噬菌体整合酶基因,显示很可能是通过溶原性噬菌体整合入基因组。基因岛包含11个编码基因,部分基因推测为可能的膜表面蛋白基因或氨基酸结合蛋白基因。结论新发现的基因岛SSGI4具有致病性基因岛的各项典型特征,可能与猪链球菌2型强毒株的致病性有关,具有深入研究的价值。
关键词 ：
猪链球菌2型 ,
基因岛 ,
SSGI4
Abstract ：A novel genomic island(GI) in Streptococcus suis serotype 2(SS2) was identified,which resided in the highly virulent strains but not in the hypo-virulent strains or avirulent strains of SS2 of the Chinese isolates.This newly discovered GI strain was designated as SSGI4 and its whole length of genome was 11 269 bps,sharing the typical properties of pathogenicity islands,such as the distinct G+C content,a mosaic architecture characteristics and the specificity for virulent isolates.There were 11 genes within SSGI4,in which some genes were putative cell surface protein genes and others were amino acid-binding protein genes.Our finding sheds light on the investigation of horizontal gene transfer in SS2 and their influence on pathogenicity.
Key words ：
Streptococcus suis serotype 2
genomic island SSGI4
收稿日期: 2009-07-20
[1]Chen Chen,Tang Jiaqi,Dong Wei,et al.Agli mpse of Strepto-coccal toxic shock syndrome fromcomparative genomics ofS.su-is2 chinese isolates〔J〕.PLoS One,2007,2(3):315.
[2]魏武,丁国徽,王晓婧,等.猪链球菌全基因组序列比较分析〔J〕.科学通报,2006,51(7):808-818.
[3]刘军,冯书章,孙洋,等.四川资阳地区猪链球菌2型检测及其特性比较研究〔J〕.中国人兽共患病学报,2007,22(12):1095-1099.
[4]Beres SB,Sylva GL,Barbian KD,et al.Genome sequence of aserotype M3 strain of group AStreptococcus:Phage-encodedtoxins,the high-virulence phenotype,and clone emergence〔J〕.Proc Natl Acad Sci USA,2002,99(15):10078-10083.
[5]Sekizaki T,Otanti Y,Osaki M,et al.Evidence for horizontaltransfer of SsuDAT11 restriction-modification genes to theStreptococcus suisgenome〔J〕.J Bacteriol,2001,183(2):500-511.
[6]Takamatsu D,Osaki M,Sekizaki T.Evidence for lateral trans-fer of the suilysin gene region ofStreptococcussuis〔J〕.J Bacteri-ol,2002,184(7):2050-2057.
[7]King SJ,Leigh JA,Heath PJ,et al.Identification of virulentclones and potential capsular serotype exchange〔J〕.J Clin Mi-crobiol,2002,40(10):3671-80.
[8]Smith HE,Vecht HJ,Wisselink N,et al.Mutants ofStrepto-coccus suistype 1 and 2 i mpairedin expression of muramidase-re-leased protein and extracellular proteininduce diseasein newborngermfree pigs〔J〕.I mmun,1996,64:4409-4412.
[1]
张莉, 王利丽, 魏财文, 杨春蕾, 路超, 池晶晶, 鄢明华. 环介导等温扩增技术结合横向流动试纸条检测猪链球菌2型的应用研究
[2]
李敏,王晶,史沛举,郭静静,杜骁杰,李先富,王长军,潘秀珍,高基民. 猪链球菌2型中国强毒株05ZYH33 ofs基因敲除突变株构建及其生物学特性研究
[3]
郭静静，杜骁杰，刘文静，郑峰，胡丹，王长军，潘秀珍. 猪链球菌2型甲基受体趋化蛋白编码基因05SSU0273的原核表达及纯化
[4]
陈经雕,刘美真,柯碧霞,谭海玲,李柏生,柯昌文. 广东省猪链球菌2型菌株毒力基因及分子分型分析
[5]
冯晓丹 王晶 顾平清 唐家琪. CiaRH生物信息学分析及其在不同猪链球菌血清型中的分布
[6]
方瑶 毛旭虎. 类鼻疽杆菌基因组学概述及进展*
[7]
何永聚 祝令伟 冯书章. 猪链球菌2型毒力相关因子及保护性抗原最新研究进展
[8]
姚苹苹, 朱函坪, 朱水荣, 张政, 梅玲玲, 陆群英. Ⅱ型猪链球菌浙江分离株cps2J、ef、mrp基因的克隆及序列分析
[9]
朱水荣;王志刚;余昭;张政;梅玲玲;杨婷婷;卢亦愚;. 应用LAMP技术鉴定含89K毒力岛2型猪链球菌菌株
[10]
姚苹苹;王复甦;朱函坪;梅玲玲;叶菊连;罗进;张政;姚晨辉;. 浙江省9株猪链球菌2型分离株Cps2J全基因克隆与序列分析
[11]
方勤美;黄绍谦;俞伏松;朱继昌;林天龙;. 猪链球菌2型福建分离株的主要毒力基因分析
[12]
孙理云;. 用生物信息学方法预测2型猪链球菌98HAH33细胞壁结合蛋白
[13]
朱水荣;王志刚;杨婷婷;金大智;张政;徐宝祥;姚萍萍;. Taqman-MGB双重探针PCR技术检测含89K毒力岛猪链球菌2型
[14]
郭长明;俞伏松;方勤美;黄绍谦;林天龙;. 福建猪群猪链球菌2型血清学调查与分析
[15]
冯晓丹;程功;王晶;王长军;潘秀珍;唐家琪;. 猪链球菌2型二元信号转导系统ciaR基因敲除突变株的构建及生物学功能研究
